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ASSOCIATED RESEARCHERS

RP2 – Marine Genomics and Native Resources

Marco Álvarez Santana

Marco Álvarez Santana

RP2 – Marine Genomics and Native Resources

marcoalvarez@unab.cl

Bioquímico, Universidad Austral, Chile, 1993.

Doctor en Ciencias, Université de Liège, Bélgica, 2000.

Publications
  1. Pulgar J, Aldana M, Álvarez M, Garcia­Huidobro R, Molina P, Morales JP and Pulgar VM. 2013. Upwelling affects food availability, impacting the morphological and molecular conditions of the herviborous limpet Fissurella crassa (Mollusca: Archeogastropoda). J. Mar. Biol. Assoc. U. K. 93 (03), 797-802.
  2. Simonet NG, Reyes M, Nardocci G, Molina A, Álvarez M. 2013. Epigenetic regulation of the ribosomal cistron seasonally modulates enrichment of H2A.Z- and H2A.Zub- in response to different environmental inputs in carp (Cyprinus carpio). Epigenetics & Chromatin 6 (1), 22
  3. Fuentes EN, Kling P, Einarsdottir IE, Álvarez M, Valdés JA, Molina M, Björnsson BT. 2012. Plasma leptin and growth hormone levels in the fine flounder (Paralichthys adspersus) increase gradually during fasting and decline rapidly after refeeding. Gen Comp Endocrinol. 177 (1), 120-127.
  4. Fuentes EN, Einarsdottir IE, Valdes JA, Álvarez M, Molina A, Björnsson BT. 2012. Inherent growth hormone resistance in the skeletal muscle of the fine flounder is modulated by nutritional status and is characterized by high contents of truncated GHR, impairment in the JAK2/STAT5 signaling pathway, and low IGF-I expression. Endocrinology. 153 (1): 283-294.
  5. Escobar S, Fuentes EN, Poblete E, Valdés JA, Safian D, Reyes AE, Álvarez M, Molina A. 2011. Molecular cloning of IGF-1 and IGF-1 receptor and their expression pattern in the Chilean flounder (Paralichthys adspersus) Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 159 (3),140-147.
  6. Fuentes EN, Björnsson BT, Valdés JA, Einarsdottir IE, Lorca B, Álvarez M, Molina A. 2011. IGF-I/PI3K/Akt and IGF-I/MAPK/ERK pathways in vivo in skeletal muscle are regulated by nutrition and contribute to somatic growth in the fine flounder. Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol., 300, (6), R1532-1542.
  7. Araya I, Nardocci G, Morales JP, Vera MI, Molina A and Álvarez M. 2010. MacroH2A subtypes contribute antagonistically to the transcriptional regulation of the ribosomal cistron during seasonal acclimatization of the carp fish. Epigenetics & Chromatin. 3, 14.
  8. Pulgar J, Álvarez M, Morales J, Garcia-Huidobro M, Aldana M. and Ojeda FP. 2010. Impact of Oceanic Upwelling on Morphometric and Molecular Indices of an Intertidal Fish (Scarthychthys Viridis (Blenniidae). Marine and Freshwater Behaviour and Physiology, 44 (1), 33-42.
  9. Delgado I, Fuentes E, Escobar S, Navarro C, Corbeaux T, Reyes AE, Vera MI, Álvarez M, Molina A. 2008. Temporal and spatial expression pattern of the myostatin gene during larval and juvenile stages of the Chilean flounder (Paralichthys adspersus). Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 151, 197-202.
  10. Goic B., Bustamante J., Miquel A., Álvarez M., Valenzuela P., and Burzio LO. 2008. The nucleoprotein and the viral RNA of infectious salmon anemia virus (ISAV) are localized in the nucleolus of the infected cells. Virology 379, 55-63.
  11. Fuentes E., Poblete E., Reyes A.E., Vera M.I., Álvarez M., and Molina A. 2008. Dynamic expression pattern of the growth hormone receptor during early development of the Chilean flounder. Comp. Biochem. Physiol. B. Biochem. Mol. Biol. 150, 93-102.
  12. Álvarez M., Nardocci G., Thiry M., Álvarez R., Reyes M., Molina A., and Vera M.I. 2007. The nuclear phenotypic plasticity observed in fish during rRNA regulation entails Cajal bodies dynamics. Biochem Biophys Res Commun. 360, 40-45.
  13. Quezada C., Navarro C., San Martín R., Álvarez M., Molina A., and Vera M.I. 2006. Genomic organization of nucleolin gene in carp fish: Evidence for several genes. Biol Res 39, 353-365.
  14. Álvarez M., Quezada C., Molina A., Krauskopf M., Vera MI., Thiry M. 2006. Ultrastructural changes of the carp hepatocyte nucleolus during seasonal acclimatization. Bio Cell 98, 457-463.
  15. Pinto R., Ivaldi C., Reyes M., Doyen C., Mietton F., Mongelard F., Álvarez M., Molina A., Dimitrov S., Krauskopf M., Vera M.I., Bouvet P. 2005. Seasonal environmental changes regulate the expression of the histone variant macroH2A in an eurythermal fish. FEBS Letters, 579, 5553-5558.
  16. Álvarez M., Molina A., Quezada C., Pinto R., Krauskopf M., and Vera M.I. 2004. Eurythermal fish acclimatization and nucleolar function: a review. J. Therm. Biol. 29, 663-667.
  17. San Martin, R., Caceres, P., Azocar, R., Álvarez M., Molina, A., Vera, M.I., Krauskopf, M. 2004. Seasonal environmental changes modulate the prolactin receptor expression in an eurythermal fish. J. Cell. Biochem. 92, 42-52.
  18. Álvarez M., Quezada, C., Navarro, C., Molina, A., Bouvet, P., Krauskopf, M., and Vera, M.I. 2003. An increased expression of nucleolin is associated with a physiological nucleolar segregation. Biochem. Biophys. Res. Com. 301, 152-158.
  19. Vera, M.I., Molina, A., Pinto, R., Reyes, M., Álvarez, M., Krauskopf, E., Quezada, C., Torres, J. and Krauskopf, M. 2003. Genomic organization of the rDNA cistron of the teleost fish Cyprinus carpio. Biol. Res. 36, 241-251.
  20. Molina, A., Corta, A., San Martín, R., Álvarez M., Burzio, L.O., Krauskopf, M., and Vera, M.I. 2002. Gene structure of the carp fish ribosomal protein L41. Seasonally regulated expression. Biochem. Biophys. Res. Com. 295, 582-586.
  21. Álvarez M., Kausel, G.,Figueroa, J., and Vera, M.I. 2001. Environmental reprogramming of the expression of protein kinase CK2 subunit in fish. Mol. Cel. Biochem. 227, 107-112
  22. Orosz, F., Olah, J., Álvarez M., Keser, G. M., Szabo, B., Wágner, G., Kovari, Z., Horányi, M., Baroti, K., Martial, J. A., Hollán, S., and Ovádi, J. 2001. Distinct behaviour of mutant triosephosphate isomerase in hemolysate and in isolated form: molecular basis of enzyme deficiency. Blood 98, 3106-3112.
  23. Maes, D., Zeelen, J. P., Thanki, N., Beaucamp, N., Álvarez M., Dao Thi, M. H., Backmann, J., Martial, J. A., Wyns, L., Jaenicke, R., and Wierenga, R. K. 1999. The crystal structure of triosephosphate isomerase (TIM) from Thermotoga maritima: A comparative thermostability structural analysis of ten different TIM structures. Proteins 37, 441-453
  24. Álvarez M., Wouters, J., Maes, D., Mainfroid, V. Rentier-Delrue, F., Wyns, L., Depiereux, E., and Martial, J. A. 1999. Role of the His12-Lys13 pair, present in thermophilic TIMs, in the adaptation to high temperature. J. Biol. Chem. 274, N°27, 19181-19187
  25. Álvarez M., Zeelen, J. P., Mainfroid, V., Rentier-Delrue, F., Martial, J. A., Wyns, L., Wierenga, R. K., and Maes, D. 1998. Triose-phosphate isomerase of the psychrophilic bacterium Vibrio marinus. Kinetic and structural properties. J. Biol. Chem. 273, N°4, 2199-2206
  26. Figueroa, J., Molina, A., Álvarez M., Villanueva, J., Reyes, A., Leon, G., and Krauskopf, M. 1994. Prolactin gene expression and changes of prolactine pituitary level during the seasonal acclimatization of the carp. Comp. Biochem. Physiol. 108B, N°4, 551-560.
  27. Vera, M. I., Norambuena, L., Álvarez M., Figueroa, J., Molina, A., Leon, G., and Krauskopf, M. 1993.Reprogramming of nucleolar gene expression during the acclimatization of the carp. Cellular and Molecular Biology Research. 39, N°7, 665-674
Projects
  1. Proteomics del nucléolo de células de carpa durante estados opuestos de aclimatización: verano e invierno: ECOS-CONICYT C02B01
  2. Dinámica Nucleolar: Estudio de factores implicados en su regulación (Col. Internacional): FONDECYT 7040132
  3. Dinámica Nucleolar: Estudio de factores implicados en su regulación: FONDECYT 1040197
  4. Inactivación de la miostatina en el pez cebra y el lenguado chileno (Paralichthys adspersus): inducción del fenotipo de “musculatura doble” FONDECYT 1050272
  5. Evaluación de la implicancia de la variante de histona macroH2A en la regulación de la expresión génica de genes ribosomales DI-UNAB (DI 28-06/R)
  6. Factores epigenéticos involucrados en la modulación de la expresión génica durante la adaptación estacional del pez Cyprinus carpio: la familia de variantes de la histona: H2A FONDECYT 1070358
  7. Análisis funcional de la variante de histona macroH2A en el transcurso del desarrollo del pez cebra (Danio rerio) ECOS-CONICYT C06B03
  8. Estudio de la función del factor TTF-I en la regulación de la expresión de los genes ribosomales durante el proceso de aclimatización estacional del pez Cyprinus carpio. DI-UNAB (DI-18-09/R)
  9. Análisis de las vias de señalización gatilladas por el eje GH/IGF-I/Miostatina en músculo de lenguado chileno: efecto de la restricción nutricional y el crecimiento compensatorio FONDECYT 1090416
  10. Estudio de la regulación transcripcional de los genes ribosomales durante el proceso de aclimatización estacional del pez Cyprinus Carpio” DFG-Conicyt 083-2009
  11. Evaluación de la respuesta epigenética mediada por el complejo nucleolar eNoSC durante el proceso adaptativo del pez Cyprinus carpio DI-UNAB (DI-45-11/R)
  12. Analysis of the epigenetic regulation in the ribosomal cistron induced by environmental stimuli in Cyprinus carpio fish. FONDECYT 1120873
  13. Centro Interdisciplinario de Investigación en Acuicultura Sustentable (INCAR). FONDAP 15110027
Congresses
  1. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “A functional fur gene in the bacterial fish pathogen Piscirickettsia salmonis”. Almarza O & J Santander.
  2. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Molecular mechanisms orchestrating iron uptake in Piscirickettsia salmonis”. Valenzuela-Miranda D, C Segovia, K Valderrama, O Almarza, C Gallardo & J. Santander.
  3. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Influence of Glucuronic acid Transferase on Intrinsic Resistance to Antimicrobial Peptides and Virulence of Edwardsiella ictaluri”Martin T, I Diaz, J Kilbourne, O Almarza, C Segovia, R Curtiss & J Santander.
  4. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Aeromonas salmonicida cyclic adenosine 3’, 5’-monophosph ate receptor protein (Crp) mutants and its virulence in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)”. Valderrama K, O Almarza & J Santander.
  5. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “A functional ferric uptake regulator in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis”. Almarza O & J Santander.
  6. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “Temperature inducible chromosomal recombination in Aeromonas salmonicida”. Santander J, Ayala M, Valderrama K, Schoffer T, Almarza O & C Segovia.
  7. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “Gene expression under iron deprivation in Piscirickettsia salmonis”. Santander J, Segovia C, Almarza O, Valderrama K, Valenzuela-Miranda Diego & C Gallardo.
Thesis Direction
  1. Robinson Jorge Fumeron Pinilla: ”Estudio del rol del factor UBF en la expresión de poblaciones de rDNA variantes durante la adaptación estacional de Cyprinus Carpio”. Doctorado en Biociencias Moleculares, Universidad Andrés Bello, 2013
  2. Catalina Fernández de la Reguera: “Estudio de la participación del complejo nucleolar eNoSC en la regulación epigenética durante el proceso de aclimatización del pez Cyprinus carpio”. Licenciatura en Bioquímica, Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, 2013
  3. Gino Alberto Nardocci Valenzuela: “Epigenetic regulation of Cyprinus carpio ribosomal cistron during the acclimatization process”
  4. Doctorado en Biociencias Moleculares, Universidad Andrés Bello, 2012. Doktorgrades der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat), Universitat Regensburg, 2012.
  5. Valentina Javiera Muñoz Vio: “Estudio de la restauración del fenotipo wild-type en peces know-down de macroH2A durante el desarrollo temprano de Danio rerio”. Bioquímico, Licenciatura en Bioquímica, Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, 2010
  6. Ingrid Araya Fuenzalida: “Cuantificación de la expresión de factores moleculares implicados en la regulación estacional de los genes ribosomales de Cyprinus carpio”. Bioquímico, Licenciatura en Bioquímica, Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, 2010
  7. Mauricio Reyes Castro: “Estudio proteomico de factores moleculares que coordinan la reprogramación génica estacional del pez Cyprinus carpio”. Doctorado en Biociencias Moleculares, Universidad Andrés Bello, 2010
  8. Nicolás Simonet Domínguez: “Estudio del factor TTF-I en el proceso de aclimatización estacional del pez Cyprinus Carpio”. Licenciatura en Bioquímica, Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, 2010
  9. Laura Inés Guajardo Cáceres: “Estudio de la proteómica nuclear del pez Cyprinus carpio durante el proceso de aclimatización estacional”. Bioquímico, Licenciatura en Bioquímica, Universidad Austral de Chile, 2006
  10. Gino Alberto Nardocci Valenzuela: “Estudio de la proteína p80-coilina de C.carpio como un marcador de Cuerpos de Cajal”. Bioquímico, Licenciatura en Bioquímica, Universidad de Santiago de Chile, 2006.
Alfredo Molina Sirguiado

Alfredo Molina Sirguiado

RP2 – Marine Genomics and Native Resources

amolina@unab.cl

Bioquímico, Universidad Austral, Chile, 1993.

Lic. en Bioquímica Universidad Austral, Chile, 1993.

Doctor en Ciencias Université de Liège, Bélgica, 2001.

Projects
  1. Modelos y diseños experimentales para investigar la función del Organo Subcomisural. FONDECYT 3 años 1994
  2. “Assessment of Biological Containment and gene flow in transgenic sterile fish” BIO4-CT97-0554 Comunidad Economica Europea 3 1997
  3. “Identification et caractérisation des facteurs protéiques permettant aux poissons et crustacés de s’adapter aux conditions de pisciculture” AGCI – CGRI. Proyecto cooperación internacional Chile – Bélgica 4 1997
  4. Estudio in vivo de la regulación transcripcional del gen que codifica para la proteína ribosomal L41 durante la aclimatización del pez Cyprinus carpio. Dir. de Investigación, UNAB 2 2002
  5. Aislamiento y caracterización de secuencias codificantes para la miostatina de lenguado chileno (Paralichthys adpersus). Dir. de Investigación, UNAB 2 2003
  6. Proteómica del nucléolo de células de carpa durante la adaptación a ambientes estaciónales opuestos: verano e invierno. ECOS-CONICYT : Comité Francés de Evaluación-Orientación de la Cooperación Científica con Chile. 3 2003
  7. “Estudios de la expresión del receptor de prolactina en el pez cebra Dir. de Investigación, UNAB 2 2004
  8. “Evaluación del fenotipo producido por el Knock-down del gen que codifica para la miostatina en el pez cebra.” Dir. de Investigación, UNAB 2 2004
  9. Dinámica Nucleolar: estudio de factores implicados en su regulación FONDECYT 3 2004
  10. Inactivación de la miostatina en el pez cebra (Danio rerio) y en el lenguado chileno (Paralichthys adspersus): Inducción del fenotipo de “musculatura doble” Dir. de Investigación, UNAB 2 2004
  11. “Variabilidad estacional y de microhábitat en la expresión de proteínas de schok térmico HSP70 en Girella laevifrons (Kyphosidae) en el gradiente intermareal” Dir. de Investigación, UNAB 1 2005
  12. Inactivacion de la miostatina en el pez cebra y el lenguado chileno (Paralichthys adspersus): induccion del fenotipo de “musculatura doble”. FONDECYT 4 2005
  13. Inactivacion de la miostatina en el pez cebra y el lenguado chileno (Paralichthys adspersus): induccion del fenotipo de “musculatura doble”. FONDECYT. Cooperación Internacional 1 2005
  14. Utilización de oligonucléotidos modificados para generar el “knockout” del gen que codifica para la miostatina del pez cebra Dir. de Investigación, UNAB 2 2005
  15. Cultivo experimental del congrio colorado (Genypterus Chilensis): Evaluación de la expresión de genes implicados en el desarrollo muscular y la calidad de la carne durante la etapa de engorda Dir. de Investigación, UNAB 2 2005
  16. Análisis funcional de la variante de histona macroH2A en el transcurso del desarrollo del pez cebra (Danio rerio). ECOS-CONICYT: Comité Francés de Evaluación-Orientación de la Cooperación Científica con Chile. 3 2007
  17. Desarrollo de tecnologías para la producción de juveniles de congrio colorado (Genypterus Chilensis). FONDEF 3 2008
  18. Análisis de las vías de señalización gavilladas por el eje GH/IGF-I/miostatina en músculo de lenguado chileno: Efecto de la restricción nutricional y el crecimiento compensatorio. FONDECYT 4 2009
  19. Fortalecimiento y consolidación de las competencias académicas e investigación científica en el área acuícola asociada al Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad Andrés Bello a través de la inserción de 2 investigadores de excelencia. “Inserción de investigadores/as postdoctorales en la academia, centros e institutos de investigación nacionales” CONICYT 3 2010
  20. Analysis of the epigenetic regulation in the ribosomal cistron induced by environmental stimuli in cyprinus carpio fish FONDECYT 3 2012
  21. Effect of chronic stress response triggered by fish farming conditions on endocrine and molecular signaling pathways involved in muscle growth in the fine flounder. FONDECYT 4 2013
Congresses
  1. Eduardo Fuentes, Diego Safian, Daniela Escobar, Cristian Valenzuela, Alfredo Molina Hormones, receptors, and signalling pathways regulating skeletal muscle atrophy in the fine flounder (Paralichthys adspersus). 17th International Congress of Comparative Endocrinology (ICCE 2013). Barcelona, España.
  2. Sylvia. Flores, R. Zuloaga, A. Retamales, C. Andrade, K. Pino, A. Molina, J.A. Valdes. IGF-I induces myostatin expression through differential activation of the signaling pathways PI3K/Akt, Calcineurin/NFAT, ERK/CREB, CamK-MEF, Smad2/3 during myoblast proliferation and differentiation. 16th International Congress of The World Muscle Society. Faros Portugal Neuromuscular Disorders. 21, 9-10, 747. 2011
  3. Eduardo Nicolas Fuentes, Bjorn Thrandur Bjornsson, Ingibjorg Eir Einarsdottir, Juan Antonio Valdes, and Alfredo Molina. Assessment of the Growth Hormone System In Vivo in a Teleost Fish: A Unique Model of Growth Hormone Resistance in Skeletal Muscle. Endocr Rev 32: P2-344. Boston USA. 2011
  4. Fumeron R., Dupré G., Molina A., Vera MI., Alvarez M. Molecular analysis of the rDNA transcriptional regulation during the seasonal adaptation of Cyprinus carpio FISH. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  5. The transcription factors NFAT, CREB and smad2/3 are differentially regulated by myostatin/IGF-1 during myoblast differentiation. Sylvia Flores, Rodrigo Zuloaga, Andrea Retamales, Alfredo Molina, Juan Antonio Valdés. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  6. Inherent growth hormone resistance in fish skeletal muscle is modulated by the nutritional status and is characterized by high contents of truncated ghr, impairment in the JAK2/STAT5 signaling pathway and low igf-i expression. Eduardo N. Fuentes Ingibjörg Eir Einarsdottir, Juan Antonio Valdes, Marco Alvarez, Alfredo Molina, Björn Thrandur Björnsson. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  7. Transient inactivation of myostatin in different developmental stages regulates differentially myogenesys in zebrafish. Navarro C., Valdés J.A. and Molina A. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  8. Navarro C., Valdés J.A. and Molina A Transient inactivation of myostatin in different developmental stages regulates differentially myogenesys in zebrafish. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  9. Analysis of the epigenetic response under conditions of cellular energy restriction during the acclimatization of c. carpio: the ENOSC complex. Fernández de la Reguera C., Nardocci G., Morales J., Molina A., Vera MI., Alvarez M. XXV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Puerto Varas Chile. Noviembre 2011.
  10. Valdés J.A., Flores S. and Molina A. Crosstalk between myostatin and IGF-1 signalling pathways during myoblast proliferation and diferentiation. 15th International Congress of the World Muscle Society, Kobe, Japón Octubre 2010.
  11. Fumeron R., Dupré G., Nardocci G., Molina A., Morales J., Vera MI. And Alvarez M. UBF levels regulatethe rDNA activity during the Cyprinus carpio (carp) seasonal adaptation. XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  12. Nardocci G., Simonet N., Morales Jp., Vera MI., Molina A. and Alvarez M. Characterization of TTF-1 factor from carp fish and its regulatory role in the ribosomal cistron during seasonal adaptation. XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  13. Guajardo L., Bouvet P., Alvarez M., Molina A., Vera MI. And Reyes AE. MacroH2A2 is involved in retinal development during zebrafish embryogenesys. XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  14. Fuentes E., Einarsdottir I., Alvarez M., Valdés JA., Björnsson T. and Molina A. The activation of the IGF-1/PI3K/Akt and the IGF-1/MAPK/ERK pathways in skeletal muscle is regulated time-dependently by nutrition and correlated with somatic growth in the fine flounder (Paralichthys adspersus) XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  15. Valdés JA., Flores S., Poblete E., Fuentes E., Vera MI. And Molina A. IGF-1 induces myostatin expresión through PI3K/Akt, calcineurin/NFAT and MEKI/ERK signaling pathways during myogenesis. XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  16. Arriagada A., Miranda C., Navarro C., Bueno S., Molina A., Gompert B., Valenzuela M., Cabello G., Carrasco N., Kalergis A. and Riedel C. Cloning and characterization of Auliscomys boliviensis sodium iodide symporter. XXIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2010.
  17. Fuentes, E.N., Valdes, J.A., and Molina, A The activation of the MAPK/ERK and PI3K/AKT signaling pathways in skeletal muscle is regulated by nutrition and correlated with somatic growth in the fine flounder (Paralichthys adspersus). 9th International congress on the Biology of fish. Barcelona, España. Junio 2010
  18. Fuentes, E.N., Safian, D., Noll, D., and Molina, A. The insulin-like growth factor (IGF) system: molecular cloning, characterization and tissue expression pattern in the fine flounder (Paralichthys adspersus) 9th International congress on the Biology of fish. Barcelona, España. Junio 2010
  19. Fuentes, E.N., Einarsdottir, I.E., Molina, A., and Björnsson, B.Th. Plasmatic growth hormone levels in the fine flounder (Paralichthys adspersus) are regulated time-dependently and by fasting and refeeding. 9th International congress on the Biology of fish. Barcelona, España. Junio 2010
  20. Fuentes, E.; Lorca, B.; Valdés, JA.; Álvarez, M.; Molina A. El estado nutricional modula los niveles de ERK/PERK en el músculo esquelético del lenguado chileno durante el crecimiento compensatorio. XXIII Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2009. R115.
  21. Delgado, I.; Navarro, C.; Fuentes, E., Ponce, M.; Álvarez, M.; Vera, MI.; Reyes, AE.; Molina, A. La inhibición de la actividad biológica de miostatina induce un aumento del crecimiento y desarrollo del pez cebra. XXIII Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2009. R46.
  22. Guajardo, L.; Barriga, E.; Bouvet, P.; Álvarez, M.; Molina, A.; Vera, MI.; and Reyes, AE. Función de la variante de histona macroH2A en el desarrollo neural de pez cebra. XXIII Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2009.
  23. Nardocci, G.; Simonet, N.; Araya, I.; Fernández, R.; Fernández de la Reguera, C.; Morales, JP.; Vera, MI.; Molina, A.; and Álvarez, M. Evaluación de los mecanismos epigenéticos involucrados en la regulación estacional de los genes ribosomales del pez C.carpio. XXIII Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2009.
  24. Ríos, E.; Molina, A.; Reyes, AE. Efecto de hipoxia sobre la expresión del mRNA de hormona de crecimiento (gh) y sus receptores (ghrs) durante el desarrollo embrionario del pez cebra. XXIII Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, Pucón Chile. Noviembre 2009. R89.
  25. Delgado, I.; Ponce, M.; Álvarez, A.; Reyes, AE.; Molina, A. Desarrollo de herramientas biotecnológicas para optimizar el cultivo de especies piscícolas. 1er Congreso en Biotecnología Acuícola Interacción Ciencia – Empresa. Puerto Varas Chile. Octubre 2009.
  26. Nardocci, G.; Araya, I.; Simonet, N.; Fernandez de la Reguera, C.; Morales, JP.; Vera, MI.; Molina, A.; and Alvarez, M. Analysis of epigenetic mechanisms involved in regulation of rRNA genes during seasonal acclimatization of the Cyprinus carpio fish. 8th International Conference on Ribosomal Synthesis. Regensburg, Alemania. Agosto 2009
  27. Valdés, J.A., Poblete E., Fuentes, E., Molina, A.. Myostatin inhibits calcium dependent signalling pathways activated by IGF-1 in myoblast XXIV reunión anual de la sociedad Chilena de Ciencias Fisiológicas, Pucón, Chile. 2009.
  28. Valdés J.A., Molina A. Myostatin inhibits calcium dependent signalling pathways activated by IGF-1 in myoblast. Abstracts of Papers at the sixty-third annual meeting of the society of general physiologists, Woods Hole, USA.2009.
  29. Delgado I, Fuentes E, Navarro C, Álvarez M, Vera MI, Reyes A, Molina A. Myostatin bioactivity blockage increases embryonic developmental speed in zebrafish. Biotecnología Habana 2008: AgroBiotecnología: nuevos enfoques ante grandes retos. Habana, Cuba Diciembre, 2008.S1-P23
  30. Eduardo Ríos, Alfredo Molina, Ariel Reyes. Expresión de Genes involucrados en el crecimiento en eventos de hipoxia durante estadíos tempranos del desarrollo de pez cebra (Danio rerio). XXII Reunión anual Sociedad de Biología Celular de Chile. Chile, Pucón. Octubre 2008. R19.
  31. Navarro C., Delgado I., Reyes A., Álvarez M. y Molina A. Análisis de la expresión de genes involucrados en crecimiento y desarrollo muscular bajo condiciones de inactivaciòn transitoria de miostatina. XXII Reunión anual Sociedad de Biología Celular de Chile. Chile, Pucón. Octubre 2008. R23.
  32. Laura Guajardo, Valentina Muñoz, Philippe Bouvet, Alfredo Molina, Marco Álvarez, Maria Inés Vera.Análisis funcional de la variante de histona macroH2A en el transcurso del desarrollo temprano del pez cebra (Danio rerio). (Functional analysis of the histone variant macroH2A during early development of zebrafish (Danio rerio). XXII Reunión anual Sociedad de Biología Celular de Chile. Pucón, Chile. Octubre 2008. R29.
  33. Araya I., Nardocci G., Morales J.P., Lucca N., Pinto R., Reyes A., Vera M.I., Molina A., Bouvet P. y Alvarez M. Estudio del rol epigenético de las isoformas mH2A2 durante la aclimatizaciòn estacional de Cyprinus carpio. XXII Reunión anual Sociedad de Biología Celular de Chile. Chile, Pucón. Octubre 2008. R158.
  34. Valdés, J.A.1, Carrasco, M.A.2, Fuentes, E.1, Molina, A. Miostatina inhibe la liberación de calcio inducida por IGF-1 en células de músculo esquelético (Myostatin Inhibits calcium release induced by IGF-1 in skeletal muscle cells). XXIII Reunión anual de la Sociedad Chilena de Ciencias Fisiológicas. P47. Coquimbo, Chile Octubre 2008.
  35. Pinto R., Reyes M., Araya I., Bouvet P., Vera MI., Molina A., and Alvarez M. Replacement with histone variants is an epigenetic mechanism involved in the modulation of ribosomal gene expression during the seasonal adaptation process of Cyprinus carpio. Dynamic organization of nuclear function, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA Septiembre 2008.
  36. Valdés J.A. y Molina A. (2008) Cross talk between myostatin and IGF-1 transduction pathways mediated by calcium in skeletal muscle cells. Society of General Physiologists. 62nd Annual Meeting and Symposium. Woods Hole, Massachussets USA. Septiembre 2008. R21
  37. Sebastián Escobar Aguirre; Erika Poblete; Juan A. Valdés, Marco Álvarez; Juan Estrada; María Inés Vera y Alfredo Molina. Molecular cloning and characterization of Chilean flounder (Paralichthys adspersus) insulin like growth factor I receptor: Analysis expression under compensatory growth protocol.1est International CGNA Workshop “Utilization of novel and sustainable products in aqua-feeds”. Chile, Temuco. Agosto 2008. P3.2.
  38. Fuentes E, Poblete E, Reyes AE, Vera MI, Álvarez M, Molina A. The Chilean flounder growth hormone receptor: Dynamic expression pattern during early development and quantitative gene expression during fasting and re-feeding in juvenile fish. Sixth International Symposium on Fish Endocrinology (6ISFE). Calgary, Alberta Canadá. Junio 2008.
  39. Delgado I., Navarro C., Álvarez M., Vera M.I. y Molina A. Desarrollo de herramientas biotecnológicas para mejorar la tasa de crecimiento del lenguado chileno: “El inhibidor del inhibidor”. XXVII Congreso de Ciencias del Mar. Chile, Viña del Mar. Mayo 2008. 36
  40. Fuentes E, Poblete E, Reyes AE, Vera MI, Álvarez M, Molina A. Caracterización del factor de crecimiento tipo insulina–I en el lenguado chileno (Paralichthys adspersus): patrón de expresión durante el desarrollo temprano y expresión cuantitativa durante el crecimiento compensatorio. XXVII Congreso de Ciencias del Mar. Chile, Viña del Mar. Mayo 2008. P170.
  41. Fuentes, EN.; Einarsdottir, IE.; Paredes, R.; Hidalgo, C.; Valdes, JA.; Björnsson, BT.; Molina A. Skeletal muscle hypertrophy in fish in vivo is regulated via Akt/TOR and MAPK/ERK signaling pathways affecting differentially the IGF system and atrogenes. XXVI Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. Puerto Varas, Chile
  42. Fernández de la Reguera C., Nardocci G., Carvajal P., Molina A., Vera MI., Alvarez M., Evaluation of the epigenetic response generated by ENOSC complex during cellular energy restriction in Cyprinus carpio seasonal acclimatization.
  43. Rodrigo Zuloaga, Jorge Aedo, Alfredo Molina and Juan Antonio Valdés. The transcription factor CREB is activated by IGF-1 to regulate myostatin expression during myoblast differentiation. XXVI Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. Puerto Varas, Chile
  44. Fumeron R., Carvajal PA.*, Rudolffi P., Dupre G., Molina A., Vera MI., Alvarez M. EPC cells as a model of ribosomal biogenesis in Cyprinus carpio during seasonal acclimatization. XXVI Annual Meeting Chilean Society for Cell Biology. Puerto Varas, Chile
  45. Fuentes, E.; Valdes, JA.; Pino, K.; Navarro, C.; Molina A. Transient inactivation of the myostatin in zefrafish during refeeding after a fasting period induces muscle hypertrophy: involvement of the ERK, Akt and SMAD signaling pathways. 7th International Symposium on Fish Endocrinology. Buenos Aires, Argentina.
  46. Fuentes, EN.; Safian, D.; Kling, P.; Einarsdottir, IE.; Valdes, JA.; Molina, A.; Björnsson BT. Dynamics of circulating leptin in the fine flounder (Paralichthys adspersus) during fasting and refeeding: correlations to signaling pathways in skeletal muscle. 7th International Symposium on Fish Endocrinology. Buenos Aires, Argentina.
  47. Fuentes, EN.; Safian, D.; Einarsdottir, I.; Valdes, JA.; Björnsson, BT.; Molina A. Involvement of the GH/IGF-I System on Skeletal Muscle Growth in the Fine Flounder. 7th International Symposium on Fish Endocrinology. Buenos Aires, Argentina.
  48. Safian, D.; Fuentes, EN.; Valdés, JA.; Molina A. Isolation and characterization of the insulin-like growth factor binding protein (IGFBP)-1 to -6 in the fine flounder: Dynamic transcriptional regulation of local (autocrine/paracrine) IGFBPs in the skeletal muscle during different nutritional statuses. 7th International Symposium on Fish Endocrinology. Buenos Aires, Argentina.
  49. Fuentes, EN.; Safian, D.; Kling, P.; Einarsdottir, I.E.; Elorza, A.; Valdes, J.A.; Molina, A.; Björnsson, BT. Nutritional status modulates the leptin/ampk pathway linked to mitochondrial biogenesis and protein synthesis: implications in cellular metabolism and growth in the skeletal muscle of the fine flounder. 10th International Congress on the Biology of Fish. Madison, Wisconsin USA
  50. Safian, D.; Fuentes, EN.; Valdés, JA.; Molina A. Dynamic transcriptional regulation of autocrine/paracrine IGFBP1, 2, 3, 4, 5 and 6 in the skeletal muscle of fine flounder during different nutritional statuses. 10th International Congress on the Biology of Fish. Madison, Wisconsin USA
Thesis Direction

Doctorado:

  1. Cristina Navarro. Transient inactivation of myostatin in different developmental stages regulates differentially myogenesys in zebrafish. Doctorado en Biociencias Moleculares. Universidad Andrés Bello. 2013.
  2. Eduardo Fuentes Jofré. Molecular and Endocrine Regulation of Muscle Growth in the fine flounder (Paralichthys adspersus). Doctorado en Biotecnología. Universidad Andrés Bello. 2012.
  3. Erika Poblete Abuter. Análisis de la expresión de genes implicados en el crecimiento muscular del lenguado chileno Paralichthys adspersus: Efecto de la restricción nutricional y el crecimiento compensatorio. Doctorado en Biotecnología. Universidad Andrés Bello. 2010.
  4. Iselys Delgado Hernández. Inactivación de la actividad biológica de la miostatina en el pez cebra mediada por el péptido asociado a la latencia (LAP). Doctorado en Biociencias Moleculares. Universidad Andrés Bello. 2009.

Magíster y Pregrado:

  1. Diego Safian. Dynamic transcriptional regulation of autocrine/paracrine igfbp1, 2, 3, 4, 5,6 in the skeletal muscle of fine flounder during different nutritional statuses. Magíster en Biología Marina y Título de Biólogo Marino. Universidad Andrés Bello. 2012.
  2. Miguel Ponce. “Efecto de la inactivación de la miostatina sobre la expresión de genes involucrados en el desarrollo embrionario del pez cebra”. Magíster en Bioquímica y Título de Bioquímico. Universidad Andrés Bello. 2012.
  3. Eduardo Andrés Ríos Morris. Estudio del efecto de la hipoxia sobre la expresión de factores miogénicos en pez cebra (Danio rerio). Magíster en Bioquímica y Título de Bioquímico. Universidad Andrés Bello. 2009.
  4. Eduardo Fuentes Jofré. Aislamiento, caracterización y expresión del factor de crecimiento tipo insulina I (igf-I y el receptor de la hormona de crecimiento (ghr) del lenguado chileno (Paralichthys adspersus): Efecto de la restricción nutricional y el crecimiento compensatorio. Magíster en Biología Marina y Título de Biólogo Marino. Universidad Andrés Bello. 2007.
  5. Sebastián Escobar Aguirre. Caracterización del receptor para igf-1 del lenguado chileno (Paralichthys adspersus) y análisis de su expresión bajo condiciones de crecimiento compensatorio. Magíster en Bioquímica y Título de Bioquímico. Universidad Andrés Bello. 2007.
Ariel Reyes Zambrano

Ariel Reyes Zambrano

RP2 – Marine Genomics and Native Resources

ariel.reyes@unab.cl

Licenciado en Bioquímica, Universidad Austral de Chile, Chile, 1995.

Bioquímico, Universidad Austral de Chile, Chile, 1995.

Doctor en Ciencias Biológicas c/m Biología Celular y Molecular, P. Universidad Católica de Chile, Chile, 2000.

Projects
  1. “Millennium Nucleus in Developmental Biology”. ICM# P02-050.
  2. “Función de los genes HIF-1α y HIF-2α en el desarrollo del pez cebra”. FONDECYT#1060441.
  3. “Función de los genes HIF-1α y HIF-2α en el desarrollo del pez cebra”. FONDECYT#7080211.
  4. “Análisis de la función del factor inducible por hipoxia-1α en el desarrollo de arborización neuronal en el sistema nervioso del pez cebra”. FONDECYT#1095128.
  5. “Function of Hypoxia-induced factor-1alpha on neural crest cells migration”. FONDECYT#1120052.
  6. “Interdisciplinary Center for Aquaculture Research”, FONDAP#15110027.
Congresses
  1. Barriga EH, Mayor R, Reyes AE. “Hypoxia Integrates Chemotaxis and Epithelial-to-Mesenchymal-Transition During Neural Crest Cell Migration”. 8th European Zebrafish Meeting. July 9-13, 2013, Barcelona, España.
  2. Barriga EH, Maxwell PH, Reyes AE, Mayor R. “Hypoxia regulates neural crest migration by promoting Chemotaxis and Epithelial-to-Mesenchymal-Transition”. 72nd Annual Meeting/17th International Congress of Developmental Biology. June 16 – 20, 2013, Cancun, Mexico. (1º premio mejor poster SDB).
  3. Espina JA, Barriga EH, Reyes AE. “Histone Deacetylase 9b is involved in neural crest development”. 72nd Annual Meeting/17th International Congress of Developmental Biology. June 16 – 20, 2013, Cancun, Mexico.
  4. Barriga, EH.; Mayor, R.; Reyes, A. In vivo regulation of Sna1b byHif-1 alpha during zebrafish neural crest cells migration. 70th Annual Meeting Society for Developmental Biology. USA, Chicago, 21/07/2011-25/07/2011. DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 356: 202 (2011).
  5. Ulloa, J.; Reyes A. Regulation of nkx2.5 and mef2C by Hif-1alpha and Hdac9 during zebrafish cardiogenesis. 70th Annual Meeting Society for Developmental Biology. USA, Chicago, 21/07/2011-25/07/2011. DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 356: 172 (2011).
  6. Guajardo, L.; Reyes, A. MacroH2A2 knockdown prevents embryonic retinal progenitor cells differentiation. 7th European Zebra fish Meeting. UK, Edimburgo, 05/07/2011-09/07/2011.
  7. Santander, L.; Barros, M.; Reyes, A. Hif-1alpha is involved in zebrafish posterior lateral line development. 7th European Zebrafish Meeting. UK, Edimburgo, 05/07/2011-09/07/2011.
  8. Barriga, EH.; Mayor, R.; Reyes, A. The Hypoxia Factor Hif-1alpha is essential for neural crest migration. CHILEAN SOCIETY FOR CELL BIOLOGY XXV ANNUAL MEETING. CHILE, Puerto Varas, 01/11/2011-05/11/2011.
  9. Guajardo, L.; Reyes, A. MacroH2A2 affects cell proliferation in retinal progenitor. CHILEAN SOCIETY FOR CELL BIOLOGY XXV ANNUAL MEETING. CHILE, Puerto Varas, 01/11/2011-05/11/2011.
  10. Santander, L.; Reyes, AE. Hif-1alpha is required for the normal formation and arborization of the trigeminal ganglion.CHILEAN SOCIETY FOR CELL BIOLOGY XXV ANNUAL MEETING. CHILE, Puerto Varas, 01/11/2011-05/11/2011.
  11. Barros, M.; Reyes, AE. Hypoxia inducible factor-1 alpha is necessary for the posterior lateral line cell-proliferation on zebrafish.CHILEAN SOCIETY FOR CELL BIOLOGY XXV ANNUAL MEETING. CHILE, Puerto Varas, 01/11/2011-05/11/2011.
  12. Barriga, EH.; Mayor, R.; Reyes, AE. In vivo regulation of sna1b by Hif-1a during zebrafish neural crest cells migration. V International Meeting of the Latin American Society for Developmental Biology. CHILE, Santa Cruz, 11/11/2010-15/11/2010
  13. Santander, L.; Barriga, EH.; Reyes A.E. Estudio de la función de Hif-1a en la arborización de neuronassensoriales en el pezcebraDaniorerio. V Congreso de la Asociación de Estudiantes de Biología de Chile. CHILE, Valparaíso, 21/10/2010-23/10/2010
  14. Barros, M.; Reyes A.E. Estudio de la función de Hif-1a en la formación de lalínea lateral posterior del pezcebra (Daniorerio). XXVII CongresoNacional de Estudiantes de Bioquímica. CHILE, Antofagasta, 04/08/2010-07/08/2010
  15. Ulloa J.A.; Reyes A.E. Regulation of nkx2.5 and mef2c by Hif-1a and Hdac9 During the Cardiogenesis of Zebrafish. Chilean Society for Cell Biology XXIV Annual Meeting. CHILE, Pucón, 01/11/2010-05/11/2010
  16. Santander, L.; Barriga, EH.; Reyes A.E. Hif-1a is Involved in the Arborization of the Trigeminal Ganglion in Zebrafish. Chilean Society for Cell Biology XXIV Annual Meeting. CHILE, Pucón, 01/11/2010-05/11/2010
  17. Guajardo, L; Bouvet, P.; Álvarez, M.; Molina, A; Vera, M.I.; Reyes A.E. MacroH2A2 is Involved in Retinal Development During Zebrafish Embryogenesis, Chilean Society for Cell Biology XXIV Annual Meeting, CHILE, Pucón, 01/11/2010-05/11/2010
  18. Barros, M.; Santander, L.; Reyes A.E. Role of the Hif-1a in the Zebrafish Posterior Lateral Line Development. Chilean Society for Cell Biology XXIV Annual Meeting. CHILE, Pucón, 01/11/2010-05/11/2010
  19. Barriga, EH.; Mayor, R.; Reyes, AE. Hypoxia-Induced Neural Crest Cells Migration. Chilean Society for Cell Biology XXIV Annual Meeting. CHILE, Pucón, 01/11/2010-05/11/2010
  20. Guajardo, L.; Bouvet, P.; Alvarez, M.; Molina, A.; Vera, M. Reyes, A. Function of the Histone Variant Macroh2a2 in the Retinal Development of the Zebrafish. 9th International conference on Zebrafish Development and Genetics. ESTADOS UNIDOS DE AMERICA, Madison, 16/06/2010-20/06/2010
  21. Ulloa, JA.;Barriga, EH.; Reyes AE. Regulation of Hif-1a by Hdac9 During the Cardiogenesis of Zebrafish. 9th International conference on Zebrafish Development and Genetics. ESTADOS UNIDOS DE AMERICA, Madison, 16/06/2010-20/06/2010
  22. Ulloa JA.; Barriga EH., Reyes AE. Regulation of Hif-1alpha by Hdac9 during the cardiogenesis of zebrafish (Daniorerio). International Meeting Science & Friendship V: The North meets thaSouth. CHILE, Santiago, 30/11/2009-04/12/2009
  23. Barriga EH.; Mayor R.; Reyes AE. In vivo regulation of sna1b by Hif-1a during zebrafish neural crest cells migration. International Meeting Science & Friendship V: The North meets thaSouth. CHILE, Santiago, 30/11/2009-04/01/2009
  24. Santander L.; Perez C.; Lizama C.; Barriga E.; Galindo M.; Tapia J.; Reyes AE.; Moreno R.; Antonelli M. Estudio del patrón de expresión de ADAM10 y 17 durante el desarrolloembrionario de pezcebra. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE. CHILE, Pucón, 01/11/2009-05/11/2009
  25. Ríos EA.; Molina A.; Reyes AE. Efecto de hipoxiasobre la expresión de mRNA de hormona de crecimiento (gh) y susreceptores (ghrs) durante el desarrolloembrrionario del pezcebra. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE. CHILE, Pucón, 01/11/2009-05/11/2009
  26. Muñoz V.; Molina A.; Bouvet P.; Vera MI.; Reyes AE.; Alvarez M. Efectofenotípico de la falta de función de la variante de histona Macroh2a2 durante el desarrolloembrionario de pezcebra. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE. CHILE, Pucón, 01/11/2009-05/11/2009
  27. Guajardo, J.; Barriga E.; Bouvet P.; Alvarez M.; Molina A.; Vera MI.; Reyes A.E. Función de la variante de histona macroh2a2 en el desarrollo neural delpezcebra. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE, CHILE, Pucón 2009
  28. Barriga EH.; Mayor R.; Reyes AE. Función de Hif-1α y Sna1b en la migración de lascélulas de la cresta neural. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE, CHILE, Pucón 2009
  29. Ulloa JA.; Barriga EH., Reyes AE. Interacciónfuncional entre histonadeacetilasa 9 y el factor inducido por hipoxia-1a durante la cardiogénesis del pezcebra. XXIII REUNION ANUAL SOCIEDAD DE BIOLOGIA CELULAR DE CHILE, CHILE, Pucón
  30. Reyes AE.; Ulloa JA. Funtional interaction between Hdac9 and Hif-1alfa in heart development of zebrafish. 6th European Zebrafish Genetics and Development Meeting. ITALIA, 2009
  31. Barriga EH.; Reyes AE. Role of Hif-1alphain the Neural Crest Cells Migration. 6th European Zebrafish Genetics and Development Meeting.
  32. Guajardo, J.; Muñoz V.; Barriga E.; Bouvet P.; Alvarez M.; Molina A.; Vera MI.; Reyes A.E. Function of the histone Macroh2a variant in the embryonic development of the zebrafish. 6th European Zebrafish Genetics and Development Meeting, ITALIA, Roma.
Thesis Direction
  1. Laura Inés Guajardo Cáceres. “Estudio de la función de la variante de histona macroH2A2 en el desarrollo de la retina del pezcebra”. Doctorado en BiocienciasMoleculares, Universidad Andrés Bello. Finalizada 2013.
  2. Juan Alberto Ulloa Valenzuela. “Interacciónfuncional entre HistonaDesacetilasa 9b (Hdac9b) y Hif-1a durante la cardiogénesis del pezcebra”. Doctorado en BiocienciasMoleculares, Universidad Andrés Bello. Finalizada 2012.
  3. Miriam Roxana Barros Suárez. “Estudio de la función de Hif-1alfa en la formación de lalínea lateral posterior del pezcebra”. Bioquímica/Magíster en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, Finalizada 2012.
  4. Eduardo Andrés Ríos Morris. “Estudio del efecto de la Hipoxiasobre la expresión de factoresmiogénicos en pezcebra (Daniorerio). Bioquímica/Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello. Finalizada 2010. Co-Director Dr. Alfredo Molina.
  5. Valentina Muñoz Vio. “Estudio del patrón de expresión y efectofenotípico de la falta de función de la variante de histona Macroh2a2 durante el desarrolloembrionario del pezcebra”. Bioquímica/Magíster en Bioquímica, Universidad Andrés Bello, Finalizada 2010. Co-Director Dr. Marco Álvarez.
  6. Diego Andrés Rojas Soto. “Caracterización de hif-2alpha durante el desarrollo del pezcebra”. Ingeniería en Biotecnología Molecular/Magíster en Ingeniería en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile. Finalizada 2008.
  7. Elías Hernán Barriga Manríquez. “Rol del factor-inducible porhipoxia (hif-1alpha) en el desarrollocardíaco del pezcebra”. Licenciatura en Biología. Universidad Austral de Chile. Finalizada 2008.
  8. Daniela Andrea Pérez Munizaga. “Clonamiento, expresión y falta de función de hif-1alpha en el desarrolloembrionario de pezcebra”. Ingeniería en Biotecnología Molecular/Magíster en Ingeniería en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile. Finalizada 2008.
  9. Carlos Sebastián Henríquez Valencia. “Rol de hif-1alpha en la proliferacióncelular del sistemanervioso central durante el desarrolloembrionario del pezcebra”. Bioquímica/Licenciatura en Bioquímica. Universidad de Santiago de Chile. Finalizada 2008.
Juan Antonio Valdés Muñoz

Juan Antonio Valdés Muñoz

RP2 – Marine Genomics and Native Resources

jvaldes@unab.cl

Analista de Sistemas, Escuela de Asistentes Técnicos (PUC), Chile, 1996.

Bioquímico, Universidad de Santiago, Chile, 2000.

Licenciatura en Bioquímica, Universidad de Santiago, Chile, 2000.

Phd. En Ciencias Biomédicas. Universidad de Chile, Chile, 2006.

Publications
  1. Solís C, Poblete-Morales M, Cabral S, Valdés JA, Reyes AE, Avendaño-Herrera R,  Feijoo C. Neutrophil migration in the activation of the innate immune response to different Flavobacterium psychrophilum vaccines in zebrafish (Danio rerio).  Journal of Immunology Research 2015, Accepted.
  2. Fuentes EN, Einarsdottir IE, Paredes R, Hidalgo C, Valdes JA, Björnsson BT, Molina A. The TORC1/P70S6K and TORC1/4EBP1 signaling pathways have a stronger contribution on skeletal muscle growth than MAPK/ERK in an early vertebrate: Differential involvement of the IGF system and atrogenes. Gen Comp Endocrinol. 2015 Jan 1;210:96-106. doi: 10.1016/j.ygcen.2014.10.012.
  3. Macqueen DJ, Fuentes EN, Valdés JA, Molina A, Martin SA. The vertebrate muscle-specific RING finger protein family includes MuRF4–a novel, conserved E3-ubiquitin ligase. FEBS Lett. 2014 Nov 28;588(23):4390-7. doi: 10.1016/j.febslet.2014.10.008.
  4. Aedo JE, Maldonado J, Estrada JM, Fuentes EN, Silva H, Gallardo-Escarate C, Molina A, Valdés JA. Sequencing and de novo assembly of the red cusk-eel (Genypterus chilensis) transcriptome. Mar Genomics. 2014 Dec;18 Pt B:105-7. doi:  10.1016/j.margen.2014.08.001.
  5. Fuentes EN, Zuloaga R, Valdes JA, Molina A, Alvarez M. Skeletal muscle plasticity induced by seasonal acclimatization involves IGF1 signaling: implications in ribosomal biogenesis and protein synthesis. Comp Biochem Physiol  B Biochem Mol Biol. 2014 Oct;176:48-57. doi: 10.1016/j.cbpb.2014.07.003.
  6. Fuentes EN, Zuloaga R, Nardocci G, Fernandez de la Reguera C, Simonet N, Fumeron R, Valdes JA, Molina A, Alvarez M. Skeletal muscle plasticity induced by  seasonal acclimatization in carp involves differential expression of rRNA and molecules that epigenetically regulate its synthesis. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2014 Jun-Jul;172-173:57-66. doi: 10.1016/j.cbpb.2014.04.005.
  7. Fuentes EN, Pino K, Navarro C, Delgado I, Valdés JA, Molina A. Transient inactivation of myostatin induces muscle hypertrophy and overcompensatory growth  in zebrafish via inactivation of the SMAD signaling pathway. J Biotechnol. 2013 Dec;168(4):295-302. doi: 10.1016/j.jbiotec.2013.10.028.
  8. Zuloaga R, Fuentes EN, Molina A, Valdés JA. The cAMP response element binding  protein (CREB) is activated by insulin-like growth factor-1 (IGF-1) and regulates myostatin gene expression in skeletal myoblast. Biochem Biophys Res Commun. 2013  Oct 18;440(2):258-64. doi:10.1016/j.bbrc.2013.09.067
  9. Fuentes EN, Valdés JA, Molina A, Björnsson BT. Regulation of skeletal muscle growth in fish by the growth hormone–insulin-like growth factor system. Gen Comp Endocrinol. 2013 Oct 1;192:136-48. doi: 10.1016/j.ygcen.2013.06.009.
  10. Fuentes EN, Safian D, Einarsdottir IE, Valdés JA, Elorza AA, Molina A, Björnsson BT. Nutritional status modulates plasma leptin, AMPK and TOR  activation, and mitochondrial biogenesis: Implications for cell metabolism and growth in skeletal muscle of the fine flounder. Gen Comp Endocrinol. 2013 Jun 1;186:172-80. doi: 10.1016/j.ygcen.2013.02.009.
  11. Valdés JA, Flores S, Fuentes EN, Osorio-Fuentealba C, Jaimovich E, Molina A.  IGF-1 induces IP3 -dependent calcium signal involved in the regulation of myostatin gene expression mediated by NFAT during myoblast differentiation. J Cell Physiol. 2013 Jul;228(7):1452-63. doi: 10.1002/jcp.24298.
  12. Fuentes EN, Safian D, Valdés JA, Molina A. Isolation and selection of suitable reference genes for real-time PCR analyses in the skeletal muscle of the fine flounder in response to nutritional status: assessment and normalization of  gene expression of growth-related genes. Fish Physiol Biochem. 2013 Aug;39(4):765-77. doi: 10.1007/s10695-012-9739-5.
  13. Fuentes EN, Ruiz P, Valdes JA, Molina A. Catabolic signaling pathways, atrogenes, and ubiquitinated proteins are regulated by the nutritional status in  the muscle of the fine flounder. PLoS One. 2012;7(9):e44256. Epub 2012 Sep 14. PubMed PMID: 23024748
  14. Safian D, Fuentes EN, Valdés JA, Molina A. Dynamic transcriptional regulation of autocrine/paracrine igfbp1, 2, 3, 4, 5, and 6 in the skeletal muscle of the fine flounder during different nutritional statuses. J Endocrinol. 2012 Jul;214(1):95-108. doi: 10.1530/JOE-12-0057.
  15. Fuentes EN, Kling P, Einarsdottir IE, Alvarez M, Valdés JA, Molina A, Björnsson BT. Plasma leptin and growth hormone levels in the fine flounder  (Paralichthys adspersus) increase gradually during fasting and decline rapidly after refeeding. Gen Comp Endocrinol. 2012 May 15;177(1):120-7. doi: 10.1016/j.ygcen.2012.02.019.
  16. Fuentes EN, Einarsdottir IE, Valdes JA, Alvarez M, Molina A, Björnsson BT. Inherent growth hormone resistance in the skeletal muscle of the fine flounder is modulated by nutritional status and is characterized by high contents of truncated GHR, impairment in the JAK2/STAT5 signaling pathway, and low IGF-I expression. Endocrinology. 2012 Jan;153(1):283-94. doi: 10.1210/en.2011-1313.
  17. Fuentes EN, Björnsson BT, Valdés JA, Einarsdottir IE, Lorca B, Alvarez M, Molina A. IGF-I/PI3K/Akt and IGF-I/MAPK/ERK pathways in vivo in skeletal muscle are regulated by nutrition and contribute to somatic growth in the fine flounder. Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2011 Jun;300(6):R1532-42. doi: 10.1152/ajpregu.00535.2010.
  18. Escobar S, Fuentes EN, Poblete E, Valdés JA, Safian D, Reyes AE, Alvarez M, Molina A. Molecular cloning of IGF-1 and IGF-1 receptor and their expression pattern in the Chilean flounder (Paralichthys adspersus). Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2011 Jul;159(3):140-7. doi: 10.1016/j.cbpb.2011.03.003.
  19. Riquelme D, Alvarez A, Leal N, Adasme T, Espinoza I, Valdés JA, Troncoso N, Hartel S, Hidalgo J, Hidalgo C, Carrasco MA. High-frequency field stimulation of primary neurons enhances ryanodine receptor-mediated Ca2+ release and generates hydrogen peroxide, which jointly stimulate NF-κB activity. Antioxid Redox Signal. 2011 Apr 1;14(7):1245-59. doi: 10.1089/ars.2010.3238.
  20. Osorio-Fuentealba C, Valdés JA, Riquelme D, Hidalgo J, Hidalgo C, Carrasco MA. Hypoxia stimulates via separate pathways ERK phosphorylation and NF-kappaB activation in skeletal muscle cells in primary culture. J Appl Physiol (1985). 2009 Apr;106(4):1301-10. doi: 10.1152/japplphysiol.91224.2008.
  21. Valdés JA, Gaggero E, Hidalgo J, Leal N, Jaimovich E, Carrasco MA. NFAT activation by membrane potential follows a calcium pathway distinct from other activity-related transcription factors in skeletal muscle cells. Am J Physiol Cell Physiol. 2008 Mar;294(3):C715-25. doi: 10.1152/ajpcell.00195.2007.
  22. Valdés JA, Hidalgo J, Galaz JL, Puentes N, Silva M, Jaimovich E, Carrasco MA. NF-kappaB activation by depolarization of skeletal muscle cells depends on ryanodine and IP3 receptor-mediated calcium signals. Am J Physiol Cell Physiol. 2007 May;292(5):C1960-70.
  23. Villanueva RA, Galaz JL, Valdés JA, Jashés MM, Sandino AM. Genome assembly and particle maturation of the birnavirus infectious pancreatic necrosis virus. J Virol. 2004 Dec;78(24):13829-38. PubMed PMID: 15564491.
Projects
  1. Proyecto CONICYT de Competencia regular. No. 1130545. 2013-2017. Effect of chronic stress response triggered by fish farming conditions on endocrine and molecular signaling pathways involved in muscle growth in the fine flounder. Supported by Grants. Co-investigador
  2. Centro Fondap Interdisciplinary Center for Aquaculture Research (INCAR). 2013-2017. Co-investigador.
  3. Proyecto Núcleo 447 – 2013- 2015. Estudio de los mecanismos de virulencia del patógeno acuícola Flavobacteriumpsychrophilum, basado en un modelo innovador de cultivo primario de células y larvas de peces. Co-investigador.
  4. Proyecto CONICYT de Iniciación. No. 11090274. 2009-2013. Cross-talk between myostatin and IGF-1 transduction pathways mediated by calcium during myogenesis.Investigador Principal.
  5. Proyecto CONICYT de Competencia regular.No1090416. 2009-2012. Analysis of signal transduction triggered by the GH/IGF-1/myostatin axis in Chilean flounder muscle: Effects of nutritional restriction and compensatory growth.
  6. Proyecto UNAB 31/11R. Regulación de la expresión de miostatina mediada por IGF-1 durante las fases de proliferación y diferenciación de mioblastos. Investigador Principal.
  7. Proyecto UNAB 08/09-R. Conversación cruzada entre las vías de señalización para IGF-1 y miostatina mediadas por calcio durante la miogenesis. Investigador Principal
Congress
  1. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “A functional fur gene in the bacterial fish pathogen Piscirickettsia salmonis”. Almarza O & J Santander.
  2. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Molecular mechanisms orchestrating iron uptake in Piscirickettsia salmonis”. Valenzuela-Miranda D, C Segovia, K Valderrama, O Almarza, C Gallardo & J. Santander
  3. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Influence of Glucuronic acid Transferase on Intrinsic Resistance to Antimicrobial Peptides and Virulence of Edwardsiella ictaluri”Martin T, I Diaz, J Kilbourne, O Almarza, C Segovia, R Curtiss & J Santander.
  4. Aquaculture 2015, Montpellier, France. “Aeromonas salmonicida cyclic adenosine 3’, 5’-monophosphate receptor protein (Crp) mutants and its virulence in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)”. Valderrama K, O Almarza & J Santander.
  5. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “A functional ferric uptake regulator in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis”. Almarza O & J Santander.
  6. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “Temperature inducible chromosomal recombination in Aeromonas salmonicida”. Santander J, Ayala M, Valderrama K, Schoffer T, Almarza O & C Segovia.
  7. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “Gene expression under iron deprivation in Piscirickettsia salmonis”. Santander J, Segovia C, Almarza O, Valderrama K, Valenzuela-Miranda Diego & C Gallardo.
  8. XXXVII Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2015 La Serena, Chile. “Analysis of endogenous recombination of vapA locus in Aeromonas salmonicida after thermal shock. Schoffer JT, Ayala M, Valderrama K, Almarza O & J Santander.
  9. XXXVI Annual reunion, Chilean Microbiology Society, 2014 La Serena, Chile. “Role of the DNA-Binding Protein HU in the Acid Stress Response Mechanism in Helicobacter pylori”. Almarza O & H Toledo  **(Best oral presentation award)
  10. Seventh International Symposium on Aquatic Animal Health, 2014  Portland, Oregon, USA “Aeromonas salmonicida cyclic adenosine 3’, 5’-monophosphate receptor protein (Crp) mutants in fish host”. Valderrama K, O Almarza & J Santander
  11. Seventh International Symposium on Aquatic Animal Health, 2014 Portland, Oregon, USA. “Response of Piscirickettisa salmonis to iron limited conditions”. Almarza O, C Segovia, V Maracaja-Coutino, C Sanchez & J. Santander
  12. Annual Meeting of the American Society for Cell Biology. 2013, New Orleans, LA, USA. “The Ca2+ activated non-selective cationic channel TRPM4 enhances cellular migration and contractility by modulating the focal adhesions dynamics”. Cáceres M, P Kang-Sik, A Romero, T Recabarren, E Leiva-Salcedo, O Almarza, J Trimmer & O Cerda.
  13. V Congress of European Microbiologists (FEMS 2013). 2013. Leipzig, Germany. “Structural-functional analysis of Helicobacter pylori HU protein”. Almarza O, D Nuñez &
Direction of Thesis
  1. Victor Aballai Valdés. 2015. Evaluación del efecto del estrés por manejo en la expresión de genes asociados a la regulación del sistema inmune del congrio colorado (Genypterus chilensis) mediante RNA-seq. Magister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  2. Cristian Saquel Escobedo. 2015. Miostatina inhibe la vía de señalización IGF 1/PI3K/PLCg/NFATc3 a través del receptor Activina tipo IB (ActRIB). Magister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  3. Mathias Iturriaga Cabello. 2015. Actividad citotóxica de Flavobacterium psychrophilum en células musculares de trucha arcoíris (Onchorhynchus mykiss). Magister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  4. Andrés Quezada Cabezas. 2015.  La vía de señalización IGF-I/Calcineurina/MEF2 participa en la regulación de la expresión génica de miostatina durante la diferenciación de los mioblastos. Magister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  5. Jorge Aedo Abadie. 2014. Análisis de la expresión global de genes asociados a crecimiento muscular en congrio colorado (Genypterus chilensis) bajo respuesta a estrés por manejo. Magister en Bioquímica, Universidad Andrés Bello
  6. Rodrigo Zuloaga Royo. 2013. Regulación de la expresión génica de miostatina inducida por IGF-1 mediada por el factor de transcripción CREB durante la diferenciación de los mioblastos, Magister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  7. Andrea Retamales. 2013. Regulación de la vía de señalización Miostatina/Smad3 mediada por IGF-1/PI3K/Akt durante la diferenciación de mioblastosMagister en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.
  8. Eduardo Fuentes Jofré (co-director). 2012. Molecular and Endocrine Mechanisms that Regulate Skeletal Muscle Growth in the Fine Flounder (Paralichthys adspersus).PhD en Biotecnología, Universidad Andrés Bello.